Les monasteres athonites avaient des scriptoria (ateliers de calligraphie) pendant presque toute la periode d'Athanase l'Athonite, dont la constitution (la "Typicon") pourvoit aux besoins en postes de calligraphes du monastere de Lavra. Cependant, de nombreuses collections de manuscripts anciens ont subis des dommages pour diverses raisons.
La premiere raison est le feu qui a frappe tous les monasteres du Mont Athos a une epoque ou une autre. La seconde cause concerne les pillards. Les Turcs detruisirent frequemment des documents afin de profiter de l'or ou de l'argent de la couverture des reliures. Il a ete calcule que, en 1822, les soldats turcs detruisirent quelques 1000 parchemins manuscripts pour faire des cartouches.
La troisieme raison est le pillage par les collectionneurs europeens. Il n'y a pas de grande bibliotheque en Europe qui ne contienne des manuscripts athonites. D'apres une grossiere estimation il y a 15 250 manuscripts grecs au Mont Athos et 800 d'entre eux sont illustres. Les manuscripts illustres datent du Xeme siecle.
Un grand nombre de bibliotheques du Mont Athos contiennent des Chrysobulles imperiaux (decrets imperiaux avec des sceaux en or).
Voir aussi une selection de manuscrits du Mont Athos.